GrenouilleTeamFrance

Rejoignez nous !!

2005-03-08T13:08:00.000+01:00

N'hésitez pas à nous rejoindre !!

Pensez aussi a nous faire connaitre, parlez en à vos proches, vos amis, vos collègues,....

Tout le monde est le bienvenue !!!

Présentation ...

2005-03-02T15:00:00.000+01:00

La question maintenant est COMMENT aider la science ??

En participant à un réseau mondial, dont un groupe s'est formé sur grenouille : la team grenouille france !
Tu installes un miniprogramme, qui va essayer de multiples possibilités de formes d'une protéine... ce sont des calculs longs, voilà, pourquoi, on se regroupe, pour accumuler un maximum de résultats en un minimum de temps...

A quoi ça sert ??

Pour faire court, les protéines sont des molécules trés importantes chez les êtres vivants, elles assurent la plupart des fonctions des organismes vivants...
ces propriétés, fonctions, dépendent de la forme que peut prendre la protéine...
connaître cette forme peut ensuite aider à "fabriquer" des remèdes contre certaines maladies, etc...

Alors tétard, grenouille, crapaud ou n'importe qui d'ailleurs, quand est ce que tu nous rejoins ????

1er étape !!

2005-03-02T14:59:00.000+01:00

Configuration système minimale :

1 - Processeur : Intel Pentium ou équivalent.
2 - Mémoire : 128Mo de RAM (avec mémoire virtuelle activée).
3 - Disque dur de 600Mo dont 50Mo minimum disponibles pour le fonctionnement du programme.
4 - Affichage 800x600 en 256 couleurs.
5 - Connexion Internet 56k.
6 - Système d'exploitation supportés : Windows 98, Millenium, 2000 ou XP.

Télécharger le programme

télécharger le programme Le programme est assez léger (1.5Mo), ce qui représente un téléchargement d'environ 8 minutes en 56K ou de 30 secondes en ADSL.

ou sur wgc à droite, dans le cadre "Become a member", cliques sur "join now".
Dans la nouvelle page, au début du texte, cliques sur le lien "download the software". Et le téléchargement devrait débuter.

Le téléchargement terminé, installes ensuite le programme et lances le.
Il faudra alors créer un compte, une fois le compte créé rejoin la team soit en allant directement à cette adresse :
www.worldcommunitygrid.org/team/viewTeamInfo.do?teamId=42Z298SPBN1
ou bien après avoir entré le login + pass, regarder a gauche et cliquer sur Find my Team puis entré GrenouilleTeamFrance...

N'oublies pas de régler ta nationalité, tu peux aussi modifier l'espace disque alloué, le nom et la planification

2e étape !!

2005-03-02T14:58:00.000+01:00

Configuration :

ð Comment régler sa nationalité ?

1/ www.worldcommunitygrid.com
2/ cliquez en haut a droite sur Member Area
3/ rentrez vos login
4/ cliquez sur My Profile qui ce trouve dans la colonne de gauche
5/ sélection dans country : France
6/ appuyez sur Save.

ð Comment modifier l’espace disque alloué ? le nom ? ainsi que la planification ?

1/ www.worldcommunitygrid.com
2/ cliquez en haut a droite sur Member Area
3/ rentrez vos login
4/ cliquez sur Devise Manager qui ce trouve dans la colonne de gauche
5/ puis cliquer cliquez sur Device Profiles
6/ cliquer sur le nom que vous avez mis à votre disque
7/ vous n’avez plus qu’à régler selon vos souhaits.

ð Je ne vois pas mes résultats sur le site, pourquoi ?

Pas de panique, le serveur ne s’est pas encore actualisé, il suffit d’attendre quelques heures,...
Le serveur ce met à jour à 01:00 , 07:00 , 13:00 et 19:00 pour les statistiques personnelles, et à 01:00 pour la team.

ð J’ai plusieurs PC sur lesquels je veux mettre WCG, comment faire ?

Pas besoin de créer un nouveau compte, il suffit de réutiliser le login/pass et lors de l’installation penser à cocher la case already registrated

3e étape !! comprendre...

2005-03-02T14:57:00.000+01:00

Débuter : Interface et fonctionnement du programme

fenêtre « home » (mageos)

fenêtre « calculs »(mageos)

Fonctionnement du programme
Le programme fonctionne en trois phases :

Téléchargement des données qui vont être calculées
Phase de calcul
Envoi des résultats obtenus

Pour les phases 1 et 3, il est donc nécessaire d’être connecté à internet, en revanche toute la phase de calcul ne nécessite pas de l’être.

Déroulement de la phase de calcul

Comme tout programme, pour tourner, ce programme nécessite de la mémoire vive (mais peu), et les ressources du processeur pour effectuer les calculs. Cela va-t-il ralentir l’ordinateur ? Non ! Car le principe même de ce programme est de n’utiliser que les ressources du processeur que les autres programmes qui tournent sur l’ordinateur (jeu, navigateur internet, traitement de texte, etc.) n’utilisent pas, autrement dit, si vos diverses activités sur l’ordinateur monopolisent 75% de la puissance du processeur, le programme utilisera les 25% restants, et si vous lancez un nouveau programme, et donc utilisez alors 80% de la puissance, alors le programme va réduire sa puissance afin de n’utiliser plus que 20% de libres. Ceci est possible car le programme est réglé en priorité basse, alors que les autres programmes sont généralement réglés en priorité moyenne, ou haute, donc ils seront toujours prioritaires sur World Community Grid Agent.

Lorsque le programme tourne, dans la barre des tâches (en bas à droite de votre écran), si vous cliquez sur l'icone turquoise du programme, une fenêtre s'affiche, les boutons en bas à droite servent à (description des boutons de gauche à droite) :

Afficher le panneau de contrôle (cf. première image ci-dessus)
- Avec des liens (en anglais) pour avoir des infos sur le projet, voir vos scores, voir les caractéristiques du dispositif que vous avez alloué au programme ; processeur, mémoire, stockage, type connexion internet
Application (cf. deuxième image ci-dessus): Voir la protéine dont sur laquelle le programme travail (l’image montre justement le repliement testé à ce moment précis), ainsi que les informations sur les calculs en cours. Signification des différentes valeurs :
- Rosetta : la valeur « Rosetta », montre si le repliement de la protéine testée est correcte, plus la valeur est négative, mieux c'est !!! La valeur min, indique donc le meilleur résultat...
- Environment : la valeur « Environnement » évalue le repliement, du point de vue du noyau de la protéine
- Pair : la valeur « paires » évalue l'appariement des acides aminés entre eux (est ce que les associations respectent les règles de complémentarités ou non ?)
Régler les préférences
- Run only as screensaver : le programme fonctionnera uniquement comme économiseur d'écran, c’est à dire qu’il ne se déclenchera en même temps que l’économiseur d’écran
- Snooze sleep for X minutes : régler le temps d’arrêt de la progression lorsque l’on clique sur le bouton « snooze » (cf. ci-dessous)
Mettre le logiciel en « snooze », c’est à dire arrêter la progression pendant un temps déterminé dans les préférences
Lancer l’aide (en anglais)
Réduire la fenêtre dans la barre des tâches

Complement FAQ ...

2005-03-02T14:56:00.000+01:00

FAQ sur l’interface et le fonctionnement du programme :

Vous faites tourner le programme et vous voyez le compteur du temps qui tourne à gauche mais pas celui de droite, et tout en bas de la fenetre vous avez "primary task is executing" ?

C'est tout a fait normal,a gauche c'est le compteur du travail en cours, tandis qu’à droite il s’agit du total de tous les calculs terminés (donc s’il s’agit de votre premier calcul, ce compteur de droite restera bloqué à 0 années, 0 jours, 0 heures 0 min 0 s jusqu’à ce que les résultats de votre premier calcul soient envoyés) !

Concrètement que fait le programme ?

C'est un peu comme une étude statistique, le programme essaie toutes les possibilités (le schéma visible dans « application » permet de visualiser le repliement testé) et regarde si c'est réaliste (les graphes, avec les chiffres à gauche du schéma)
Quand il a étudié toutes les possibilités, il renvoie au serveur, le meilleur résultat obtenu ...

Combien de temps dure la phase de calcul ?

Selon les protéines, tester toutes les possibilités de repliement prend plus ou moins de temps, c'est pourquoi, vous allez avoir des calculs qui vont durer 5h, d'autres 20, d'autres 100h, d'où l'utilité du pourcentage effectué à coté du temps passé !

Votre ordinateur est un Athlon, et lorsque vous regardez les ressources processeur utilisées lorsque le programme tourne, vous n’êtes pas à 100% utilisés au total par l’ensemble de vos programmes ?

Cela peut être dû à l’utilisation d’un logiciel qui active le bit S2 des Athlon. Ca permet de mettre le processeur en état de veille lorsqu'il n'est pas utilisé à 100% donc de faire descendre la température de ce dernier de 10° environ en « idle ». Quand vous le désactivez, le logiciel Proteom_folding (rosetta) remonte à 90 ~ 100%.

"Le soft que j'utilise (Vcool) est propriétaire à mon chipset antédiluvien (KT133A) mais il en existe un autre qui fonctionne avec à peu près tous les chipsets pour athlon si ca vous interesse :
http://www.stargaz0r.nm.ru/ "

J'ai un mac et je voudrais aussi participer :
Sur le lien suivante plus d'info a ce propos
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/w...?thread=316#724

Remarque :

Il est prevu qu'un client Linux sorte en 2005, donc ça ne devrait pas tarder....

l'equipe ...

2005-03-02T14:00:00.000+01:00

Je tien à signaler que ce blog n'aurait pu voir le jour sans l'aide de PetiteClaire, Cedric1912, et tout nos autres joyeux lurons qui permet à la team de vivre dans la joie et la bonne humeur : )

iomy

Les membres .....

2005-03-02T13:00:00.000+01:00

Voilou donc ici vous pouvez retrouver tous les membres dans les commentaires ;)
j'invite chacun de nos membres a venir mettre un commentaire avec la puissance de leur processeur ( en Mhz ou Ghz ) , la quantité de RAM ( en Mo ) et toute info que vous souhaitez à propos de vous et autre....